부가가치세 전자신고세액공제액이 총수입금액에 포함되는지요?

네.

전자신고세액공제 받은 부가가치세 과세기간 종료일이 속하는 과세기간의 소득금액계산시 사업소득 총수입금액에 산입하는 것입니다.