공동명의 주택의 기준시가 판단은 인별로 안분하나요?

아닙니다.

공동명의의 주택취득시 장기주택저당차입금 이자상환액 공제대상 주택의 가격은 인별로 안분하는 것이 아니라 당해 주택의 기준시가를 기준으로 판단합니다.