수정세금계산서도 합계표상 발급매수에 포함하여야 하나요?

네. 포함합니다.

수정세금계산서도 정상적으로 발급된 세금계산서로 부가가치세 신고 시 세금계산서합계표 상 발급매수에 포함하여 신고하면 됩니다.